بررسی بر هم کنش داروی ضد سرطان دوکسوروبیسین با نانو صفحه گرافن با روش مکانیک کوانتومی و دینامیک مولکولی

پایان نامه
چکیده

چکیده در حال حاضر به خوبی ثابت شده است که خواص ذرّات در حدّ نانو از خواص همان ذرات در مقیاس بزرگتر کاملاً متفاوت است. گرافن ها و نانو صفحات نیز از این امر جدا نیستند. با توجّه به افزایش علاقه درباره یِ این صفحات، مطالعات مولکولی با روش شبیه سازی دینامیک مولکولی انجام گرفته است. اهمیّت ترکیبات دارویِ دوکسوروبیسین، در درمان سرطان، ما را بر آن داشت تا چگونگی برهمکنش این دارو با صفحه یِ گرافن را مورد بررسی قرار دهیم. ما تلاش کردیم با استفاده از تئوری تابعیِ چگال(dft)، در سطح محاسباتیِb3lyp/6-31g*، پایدارترین ساختار داروی دوکسوروبیسین را به دست آورده و همچنین چگونگی جذب داروی ضدّ سرطان دوکسوروبیسین بر روی صفحه یِ گرافن را مطالعه نماییم. محاسباتdft بوسیله یِ بسته یِ نرم افزاریِ گوسین 2003 و محاسبات شبیه سازی به وسیله یِ dl_poly انجام شده است. تابع توزیع شعاعی(rdf) به عنوان کمیت آماری جهت توصیف جهت گیری مولکولها بر روی صفحه یِ گرافن به کار رفت. rdf برایِ برهمکنش اتمهایِ دارو با صفحه بیانگرِ آن است که برهمکنش دارو با اتمهایِ مرکز صفحه قوی تر است. بنابر این می توان گفت که دارو تمایل به ایجاد یک چند لایه بر روی صفحه یِ گرافن دارد و تمایل کمتری به برهمکنش به اتمهای لبه یِ صفحه یِ گرافن از خود نشان می دهد. قوی ترین برهمکنش مربوط به اتمِ o_60 می باشد که پیک قوی در فاصله 3.43 آنگسترومی دارد. این پیک احتمال زیادی نیز دارد و بیانگر برهمکنش قوی با صفحه از این سایت مولکول است. کلمات کلیدی: دارویِ ضد سرطان دوکسوربیسین، صفحه یِ گرافن، روش کوانتوم مکانیکی، روش دینامیک مولکولی

منابع مشابه

بررسی بر هم کنش داروی ضد سرطان دوکسوروبیسین با صفحه بورن نیترید به روش مکانیک کوانتوم ودینامیک مولکولی

چکیده: اهمیت ترکیبات دارویی دوکسوروبیسین، در درمان سرطان، ما را بر آن داشت تا چگونگی اثر جذب این دارو را بر صفحه بورن نیتریدمورد بررسی قرار دهیم.ساختار بهینه دارو با استفاده از روش تابعی چگال(dft)، در سطح محاسباتی b3lyp/6-31g*، به دست آمد. سپس با تکرار این ساختار بهینه در طرفین یک صفحه بورن-نیترید حاوی 600 اتم، چگونگی جذب دارو بر روی صفحه بورنیترید محاسبه گردید. محاسبات کوانتوم مکانیکی به وسی...

15 صفحه اول

مقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure

کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...

متن کامل

شبیه سازی دینامیک مولکولی برهم کنش داروی ضد سرطان پاکلی تاکسل با برخی نانو ذرات پروتئینی

هدف پایان نامه، مطالع? سایت های برهم کنش کنند? مابین دارو و نانوذرات پروتئینی است.همچنین بررسی احاطه کردن دارو توسط نانوذرات پروتئینی می باشد. این کار با بررسی فواصل و تعداد برخورد، پیوند هیدروژنی ما بین دارو و نانوذرات پروتئینی، امکان برهم کنش دارو با زنجیر جانبی آمینواسید نانوذرات پروتئینی می باشد. تصاویر هر یک از سیستم ها نیز در این پایان نامه آورده شده است.

شبیه سازی دینامیک مولکولی برهمکنش داروی ضد سرطان پاکلیتاکسل با غشای سلولی: بررسی تغییرات انرژی واندروالسی و فاصله مرکز جرم

به دلیل افزایش روزافزون سرطان و تولید داروی جدید در درمان آن در این تحقیق به بررسی برهمکنش داروی جدید ضد سرطان آبگریز پاکلیتاکسل بر روی غشای سلولی با استفاده از ابزارهای محاسباتی پرداخته شده است. از نرم افزار دینامیک مولکولی NAMD و همچنین، نرم افزار VMD برای آماده سازی فایل های ورودی که از بانک داده های پروتیین گرفته شده بودند˛ جهت شبیه سازی و همچنین تحلیل و بررسی داده های خروجی استفاده شده است...

متن کامل

مطالعه بر هم کنش های بین مولکولی الکلها و ترکیبات آلی با روش های مکانیک کوانتومی

در این پروژه انرژی برهم کنش بین مولکولی برای هفت سیستم دوجزئی متان + هیدروژن سولفید، استونیتریل + آب و بنزیل الکل + 1- آلکانول ها با استفاده از روش های مکانیک کوانتومی محاسبه شد. ساختارهای اولیه به وسیله روش های نیمه تجربی بهینه شد و خروجی به وسیله روش های از اساس به طور کامل بهینه شد. محاسبات فرکانس روی ساختارهای کامل بهینه شده انجام شد. این محاسبات نقاط ایستاده را تعیین می کند. سرانجام انرژی ...

15 صفحه اول

بررسی میانکنش پپتید ضد میکروبی سیکلوویولاسین o2 با غشا باکتری با روش شبیه سازی دینامیک مولکولی

چکیده سیکلوتیدها پپتیدهای کوچک غنی از باندهای دی سولفید هستند که از گیاهان جدا شده اند و دارای طیف وسیعی از فعالیت های زیستی شامل فعالیت ضد میکروبی، ضد تومور، حشره کشی وAnti-HIV می باشند. با توجه به افزایش باکتری های مقاوم به دارو، جامعه ی جهانی در حال رویارویی با یک چالش جدی است و نیازی ضروری به ترکیبات جدید برای درمان بیماری ها احساس می شود. سیکلوتید ها به عنوان پپتیدهای کوچک، پتانسیل بالایی ...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

دانشگاه آزاد اسلامی - دانشگاه آزاد اسلامی واحد مرودشت - دانشکده علوم پایه

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023